Avec le réaménagement muséographique des collections (1988-1992) et la réouverture du musée en 1992, une petite salle d’expositions temporaires a été créée : ce nouveau lieu permet de proposer chaque année au public une exposition-dossier nouvelle sur des thématiques diversifiées. Entièrement conçues et réalisées par le musée en partenariat scientifique avec les divers acteurs de l’archéologie régionale, ces expositions ont traité tour à tour :

• de l’actualité archéologique régionale (avec la série "Fouilles récentes"),
• des collections de provenance extra-régionale habituellement conservées en réserve : Égypte, Proche-Orient, Italie du Sud,
• de thématiques ouvertes sur des périodes chronologiques plus larges et traitées de façon pluridisciplinaire : médecine et anthropologie, rites funéraires, utilisation de l’Antiquité par la publicité commerciale…
• de l’histoire de l’archéologie régionale et des grandes étapes de son développement au cours des 19^e et 20^e siècles,
• et aussi… d’"archéologie du futur", à travers les créations de l’artiste Raymond Émile Waydelich et une réflexion sur la mémoire et le devenir de notre civilisation.